​​Pendant la Seconde Guerre mondiale, l'aérodrome fait partie du 21è groupe (formation) et sert d'école de pilotage. L'école est équipée de Masters, Oxfords, Spitfires et Blenheims. Des écoles de formation pour les équipes au sol sont également en place.

​En octobre 1941, la 3è unité d'entraînement opérationnel (côtière) est basée à Cranwell. En mars 1943, ils sont impliqués dans un accident au cours duquel un avion s'écrase dans un bâtiment universitaire. Un incendie éclate dans le bâtiment et trois membres d'équipage sont tués. L'unité quitte l'aérodrome en juin 1943.

​L'aérodrome sert également à tester de nouveaux types d'avions. Cela comprend entre autres un court vol d'un avion Gloster à réaction par le pilote d'essai, le lieutenant Gerry Sayer en 1941.

​Aujourd'hui, l'aérodrome est toujours utilisé par la RAF et abrite le collège de formation des officiers.