Port Augusta po raz pierwszy stał się znaczącą twierdzą w XVI wieku.

Reżim faszystowski zmodernizował twierdzę, budując hangar dla sterowców, port dla wodnosamolotów i tamę. Od 1934 r. marynarka wojenna założyła tam bazę morską do patrolowania Morza Śródziemnego, a od 1938 r. szkołę treningową dla dowódców poruczników.

We wrześniu 1941 r. powstał Piazza Militare Marittima, powierzony najpierw Luigiemu Notarbartolo, a następnie, od 8 czerwca 1943 r., admirałowi Priamo Leonardiemu, którego szefem sztabu był kapitan fregaty Luigi Gasparrini.

Pomimo silnego bombardowania w dniu 13 maja 1943 r., baza pozostała główną fortyfikacją wyspy. O 10:35 w dniu 12 lipca 1943 r. brytyjski niszczyciel Exmoor i grecki niszczyciel Kanaris1 weszły na redę Augusty, a następnego dnia oddziały brytyjskie wkroczyły do Augusty bez przeszkód.

17 lipca w dwóch jaskiniach w kanale Brucoli, wielu ludzi schroniło się przed bombardowaniem. Niestety, nie uniknęli oni niebezpieczeństwa i miejsce to także zostało zbombardowane. W wyniku tego ataku 50 osób straciło życie.

Baza pozostawała pod tymczasową brytyjską kontrolą do 1946 r., a następnie wznowiła działalność w 1951 r. Mieściła ona wtedy różne wydziały i ośrodki szkoleniowe.

Obecnie jest to ważny arsenał z zakładem demagnetyzacji i mieści bazę NATO, siedzibę COMFORPAT (Dowództwo Sił Patrolowych ds. Nadzoru i Obrony Wybrzeża) oraz Autonomiczne Dowództwo Wojskowe Sycylii. Na terenie kompleksu znajdują się różne miejsca pamięci, w tym pomnik Terravecchia, wzniesiony w 1968 r. w celu upamiętnienia misji w Valletcie, oraz pomnik z 1995 r., upamiętniający ostatnią misję II wojny światowej.

Kolekcja muzealna została założona w październiku 1986 roku z inicjatywy Tullio Marcona. W grudniu 1990 roku kolekcja została otwarta dla publiczności w Bastionie św. Jakuba w Castello Svevo , a Tullio kierował nią aż do swojej śmierci w 2006 roku.

Muzeum zostało tymczasowo zamknięte w styczniu 1996 roku, a następnie ponownie otwarte w 2009 roku. Od maja 2012 r. kolekcja mieści się w Palazzo di Città (Pałacu Miej skim), gdzie można ją obecnie zwiedzać.

Celem muzeum jest katalogowanie, przechowywanie i eksponowanie zabytków, historycznych artefaktów, fotografii i różnych dokumentów dotyczących miasta Augusta, sił powietrznych i marynarki wojennej. Szczególną uwagę zwraca się na operację Malta 2 i zatopienie Conte Rosso w 1941 roku.